главным героем в очередной раз является Сэм Фишер - сотрудник элитной группы "Третий Эшелон", которая была создана АНБ для выполнения задач, требующих точности и бесшумности. На этот раз действие происходит в Восточном Тиморе, где Сухади Садоно - лидер индонезийских антисепаратистов - держит в заложниках сотрудников американского посольства. Дело настолько сложное, что Садоно разработал террористический план (название Pandora Tomorrow), который предполагает взорвать несколько биологических бомб в уязвимых точках Соединенных Штатов в тот момент, когда он будет убит. Основная задача героя-получить информацию об их местонахождении.